牛顿和苹果树讲述了一个名叫Xiji Asanaga的年轻人的冒险经历，该年轻人与女友Yotsuko Utakan一起寻找一个在莫名其妙的情况下消失的祖母。英雄们一直在寻找失踪的亲戚，直到由于奇怪的设备而发现自己。几个世纪以前，主角遇到了一个女孩，该女孩掩盖了艾萨克·牛顿（Isaac Newton）的形象，艾萨克·牛顿（Isaac Newton）发现了普遍的重力定律。在女孩面前出现不寻常的主角使她想到了这一伟大的发现，后来导致了有趣的情况。
牛顿和ZE EPL三处的用户将观察到故事情节，该故事情节将达到5个可用结局之一。该游戏是一个视觉短篇小说，它将能够在动漫风格的Kat-Scenes中进行交互性互动。用户将能够影响故事，从某些方面选择选举。将不得不阅读人之间的对话Najam，用Suji Asanaga的复制品确定。通过大约需要15-30个小时的实时时间，使游戏玩家揭示了与与女孩建立关系相关的所有拱门。这个年轻人将能够更详细地了解五个女主角中每个女主角中的个人故事，并与英雄交流。主要的任务是找到回家进入本地维度的方法。