青少年忍者神龟是一种冒险行动，游戏玩家将再次遵循巨大的突变乌龟的故事。由于奇怪的化学物质，小动物以强度和速度变成了人形乌龟。
英雄长期以来一直袭击了Schredder，但他们在纽约时代仍然有许多敌人。该剧情讲述了Max Winters，这是一位百万富翁，他想打开一个3000年前关闭的门户网站。很长一段时间，永生和疯狂的力量，但是保护他的生物摧毁了战争王的所有仆人，痴迷于捕捉整个星球的目标。最后，统治者掌握了他的力量，但开始徘徊直到门户再次开放。
玩家将能够为每个主要角色效力：
- Leonardo-leonardo-the Diartachment of the Diarachment，果断而勇敢的战士。他有一个蓝色的面具和忍者，类似于武士刀。
- RAFEl戴着红色面具，并熟练拥有匕首 – 萨伊。
- 米开朗基罗（Michelangelo） – 最幽默和无忧无虑的英雄。他有一个橙色的面具，并在双节棍的帮助下与敌人感到惊讶。
- 整个公司的“大脑”，在技术方面拥有巨大的知识，与计算机和代码合作，打破门，为其团队创建各种小工具。它有紫色面具和第六bo的武器。
基本上，必须克服障碍和战斗。得益于乌龟的力量，所有困难变得非常容易。与新老板战斗：Gato，Mon，Sickle，Agila和Schredder本人。